При поступлении в институт в любом случае нужны дополнительные занятия. Ну или очень-очень специфическая школа (куда никто не мешает целенаправленно поступить в старших классах, определившись с институтом).
У экстерна в этом случае преимущества в наличии свободного времени и сил на эти дополнительные занятия.